招收研究生专业与方向：

博士研究生：生物学（动物生物学-生物信息学、基因组学方向）

硕士研究生：生物化学与分子生物学二级学科学术型研究生（生物信息学、基因组学方向方向）

                    农业硕士（食品加工与安全、资源利用与植物保护领域）

教育与工作经历：

2017.12 − 至今，   重庆师范大学，生命科学学院，教授

2014.08 − 2015.08，俄克拉荷马大学，访问学者

2012.12 − 2017.11，重庆师范大学，生命科学学院，副教授

2010.07 − 2012.11，重庆师范大学，生命科学学院，讲师

2004.09 − 2010.06，中国科学院，昆明动物研究所，硕士/博士

2000.09 − 2004.07，陕西师范大学，生命科学学院，本科

教学情况：

1.主讲《生物专业英语》、《基因组学》、《生物信息学》等本科课程及《基因组学与蛋白质组学》、《R语言绘图》等研究生课程；指导多届本科教学实习。

2.指导本科生参加“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛、大学生创新创业训练项目、中国“互联网+”大学生创新创业大赛、昇腾AI创新大赛（华为）等，获多项省部级奖励；获本科生优秀导师奖。

科研简况：

主要从事多组学与人工智能、生物信息学、化学计量基因组学及其在生物大数据分析的应用研究。已在Briefings in Bioinformatics, BMC Genomics, BMC evolutionary biology, Zoological Research, Scientific Reports, Parasite& vector, Insect science等国内外学术期刊上发表论文近50篇，单篇引用次数135次，H-index达到13；合作出版英文著作1部；主持国家自然科学基金2项、重庆市自然科学基金3项、重庆市教委科技项目3项。  

获奖情况：

2022年中国商业科技进步奖一等奖；

2015年重庆市科学技术奖三等奖；

2010年中国科学院朱李月华优秀博士生奖；

2010年云南省优秀科技论文奖一等奖；

发明专利：

一种化学计量基因组基础分析的计算方法, 发明专利, 202110905333.9。

一种化学计量基因组和基因组注释文件联合分析方法, 发明专利, 202110906004.6。

一种批量分析多物种化学计量基因组的方法, 发明专利, 2021109053。

一种高通量分析多物种化学计量蛋白质组的方法, 发明专利, 202210259556X。

一种高通量分析多物种化学计量转录组的方法, 发明专利, 202210159540。

学术兼职：

中国昆虫学会基因组学专委会委员；

重庆市生物信息学会常务理事；

《Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences》编委；

代表性论文(近5年)：

1. Zeyu Luo, Rui Wang, Yawen Sun, Junhao Liu, Zongqing Chen, Yu-Juan Zhang*. Interpretable Feature Extraction and Dimensionality Reduction in ESM2 for Protein Localization Prediction. Briefings in Bioinformatics. 2024. DOI: 10.1093/bib/bbad534. （中科院一区，IF=9.5）

2. Yu-Juan Zhang, Zeyu Luo, Yawen Sun, Junhao Liu, Zongqing Chen*. From Beasts to Bytes: Revolutionizing Zoological Research with Artificial Intelligence. Zoological Research. 2023. 44(6): 1115-1131. （中科院一区，IF=4.96）

3. Yu-Juan Zhang*, Muhammad Tahir Khan, et al. Novel Mutations in Putative Nicotinic Acid Phosphoribosyltransferases of Mycobacterium tuberculosis and Their Effect on Protein Thermodynamic Properties. Polymers.2022, 14(8), 1623. （JCR1区，中科院二区，IF=5）

4. Yu-Juan Zhang, Yang Lan, Bin Chen*. ASDB: A comprehensive omics database for Anopheles sinensis. Genomics. 2021, 3 (113): 976-982. （JCR1区，中科院二区，IF=6.205）

5. Xiaoyan Zuo, Bo Li, Chengxu Zhu, Zhengwen Yan, Li M, Xinyi Wang, Yu-Juan Zhang*. Stoichiogenomics reveal oxygen usage bias, key proteins and pathways associated with stomach cancer. Scientific Reports. 2019 Aug 5; 9(1): 11344. （JCR1区，中科院二区，IF=4.96）

6. Yu-Juan Zhang, Chengxu Zhu, Yiran Ding , Zhengwen Yan, GongHua, Yang Lan, Jian-Fan Wen*, Bin Chen*. Subcellular stoichiogenomics reveal cell evolution and electrostatic interaction mechanisms in cytoskeleton, BMC Genomics. 2018. 19(1): 469. （JCR1区，中科院二区，IF=4.76）

7. Yongqin Yin^#, Bo Li^#, Kejie Mou, Muhammad T. Khan, Aman C. Kaushik, Dongqing Wei, Yu-Juan Zhang*. Stoichioproteomics reveal oxygen usage bias, key proteins and pathways in glioma. BMC Med Genomics. 2019. 29; 12(1):125. （JCR2区，IF=2.7）

Research gate:  https://www.researchgate.net/profile/Yu-Juan-Zhang

每年招收博士生1名，硕士生（学术型）2名，硕士生（专业型）1-2名，欢迎加入我们的团队。

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